神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
然而─── 这群人的真实身份，是与企图毁灭世界的神秘灾难抗争的 英雄。 通过现场演出 让人们为之狂热，并集结这份力量而战。 但由于表面上看起来只是演出， 世人并不知道这群人是英雄。
讲述了7位性格迥异的人鱼公主，第一次踏上人类陆地学校，在克服陌生的新环境、对抗黑曜石的过程中，公主们逐渐认知自我，学会团结，勇于担当，最终收集破碎的泡泡宝石，承担守护海洋和人类的故事。每一位公主拥有独特的性格， 在战斗和生活中逐渐学会团结，共同战斗。
