贺力王（樊少皇 饰）自幼蛮力过人，后经家族之世交善鬼（丹波哲郎 饰）指点，习得精纯硬气功。力王女友莹莹意外撞破毒贩交易，毒贩将莹莹捉回使其坠楼身亡，力王击毙毒贩为女友报仇，因此被关入国分监狱。时值2001年，监狱被私人承包成为盈利工具，犯人遭受残暴对待苦不堪言。力王不能容忍国分监狱北仓杀手山猫欺凌弱小，出手将其重伤，触怒北仓天王鸣海，副监狱长单眼蛇挑斗二人对决，力王出手轰杀鸣海，自此卷入与国分监狱四仓中其他三大天王黄泉、泰山、白神的连番战斗。力王烧毁监狱中的罂粟地，使度假归来的监狱所长（何家驹 饰）大为光火，而同样习练硬气功的所长，将是力王最强大的敌人…… 　　本片根据同名日本漫画改编。

皮特（郭富城 饰）自幼失去了父母，和哥哥格瑞高（吕良伟 饰）过着相依为命的生活。皮特一直生活在哥哥无微不至的照顾之下，从来不用为生计苦恼。格瑞高的真实身份，是专攻网络的黑客特工，让皮特没有想到的是，哥哥竟然因为参与了攻击国防安全系统，出卖情报而惹来了杀生之祸。 　　皮特失去 了哥哥的庇护，坚信哥哥的清白，亦知道相信哥哥的只有自己。他联手好友班尼（吴彦祖 饰）和珍妮特，来到了新加坡，开始着手调查事件的真相。随着时间的推移，调查的深入，一个关系到国防安危的阴谋渐渐浮出了水面。皮特和警方合作，决心找出幕后黑手，替哥哥报仇。

方家两兄弟龙进（陈晓东 饰）和龙就（吴镇宇 饰）自小就在外婆家相依为命，然而，在龙就8岁的时候，他做了一件所有人看来都不可思议和不能原谅的事：小龙就拿了外婆家里的5万块钱，之后失踪了。哥哥的离去一直令到龙进耿耿于怀，其一是因为他拿走了外婆的5万块钱，但更多的是对他不辞而别抛弃自己而不解。　　一晃数年过去了，龙进已经长大成人，还结交了一个要好的女友Jess（吴佩慈 饰）；另一方面，龙就已是泰国黑帮的一员，还和黑帮兄弟一哥的妹妹阿雪（梁咏琪 饰）相恋了。外婆过世后，龙进终于有机会去解开他多年的心结，于是，他带着Jess踏上前往泰国寻找龙就的航班。

台风过境，阴霾的天色不知会在闭港的小岛上空持续多久，陈旧的民宅内，几个帮派人物突遭袭击，来人身手矫健，斩去当家马天泰之首级后消失于夜色…… 　　次日，小岛女警晓禾（Celina Jade 饰）为救自家的猫坠树，一过路男子相救，他自称阿布（吴京 饰）。两人在食档与三名泰国悍匪狭路相逢，晓禾耿直但无法抵敌，阿布出手拼倒三人，随晓禾暂留警局。阿布令属意晓禾的警员泰山（森美 饰）大为吃味，同袍关公（许绍雄 饰）与靓宝（方力申 饰）冷语调笑，给这孤独的小岛警局凭添了不少温馨活气。 　　马天泰遗孀佐佐木（青山伦子 饰）命手下肥荣（林雪 饰）带人登岛，寻回马爷头颅凑成全尸，孰料晓禾与泰山巡逻中发现藏尸处反将尸身也带走，肥荣等人冲入警局抢尸，混战中靓宝中枪殉职。 　　港口重新开放，大批警员登岛，阿布因断头案的嫌疑被短暂扣留后释放，他虽然能瞒过警方，却无法摆脱佐佐木的追杀，晓禾被...

刑警李国强（余文乐 饰）击毙了杀人魔王陈福来，自己也身中数枪生命垂危。他在医院休养了四十九天，但刚刚出院就告知职位已被调至杂物科，只因为他的证词里有一些科学无法解释的灵异现象。来到杂物科的李国强遇见了黄警督（郑伊健 饰），这个微胖又酗酒的中年人告诉他，和别的部门不同，杂物科专门处理那些所谓的“灵异事件”，但若想在这里生存下去，就必须坚定一个信念，那就是第一诫：“这个世上没有鬼！”可是这个世上却真的是有鬼的，连月来发生的数起诡异的自杀案件引起了李国强的注意。通过调查，他发现这是陈福来的魂魄杀心不改，他可以通过触碰附在任何人的身上，然后操纵他们的身体为所欲为。为了制伏凶手，李SIR和黄SIR强强联手，展开了一场惊心动魄的大追击。然而就在此时，李国强却渐渐的分不清楚，一直都在鼎力帮助自己的黄警督，他到底是敌是友。

冷血杀手专杀嫖客，将受害者的下体割去。负责调查的古Sir毫无头绪，马夫金大班亦追查此事。警署食堂员工亚毛是虔诚教徒，遇上一伴唱女郎，惊为天人，露出可怖身份。

　　一名代号 13 的杀手在一次任务中险些失手，之后她被自己所属的组织“阴影”所停职。在一段时间后，这位杀手遇到了Monji，一个不幸失去母亲的小男孩。在Monji意外失踪后这位杀手开始了寻找Monji的路途，她甚至不惜对抗她所属的组织。

缩骨谢是警方的线人，给警方提供过不少十分有价值的情报，某日，他在马来西亚离奇死于非命，黄维邦（李子雄 饰）是重案组的警探，以枪法精准著称，却因为患上了手疾而无法胜任工作，准备离职。缩骨谢和黄维邦曾经有过一段往事，前者是后者的救命恩人，缩骨谢死的蹊跷，令黄维邦决心接下此案，调查幕后真相。 　　联手督查翁振富（卢景华 饰）、警探金沙展（郭追 饰）、师兄伦国强（黄衍蒙 饰），一只精锐的专案小组成立了，众人将调查的重点放在了富商贺加年（翁世杰 饰）的身上，哪知道这只狡猾的老狐狸隐藏颇深，没有留下任何蛛丝马迹。与此同时，黄维邦发现，他们的一举一动都被某位神秘人物尽收眼底。

为了侦破棘手案件，警方往往借助线人之手获取情报。然而在行动过程中，却常常有意无意置线人于危险之地。一年前，线人废噏（廖启智 饰）的悲惨下场让香港警察李沧东（张家辉 饰）的身心备受煎熬，表面的荣迁始终洗刷不掉铭刻其心中的罪恶感。而如今，他不得不再次与新的线人合作。这次，他找到了命运多舛的小混混何细鬼（谢霆锋 饰）。为了搭救身陷水火的妹妹，细鬼无奈接受了李沧东的任务，打入金行大盗华天（陆毅 饰）的团伙内部获取情报。　　在细鬼的帮助下，警方掌握越来越多的证据，抓捕的罗网也渐渐收拢。与此同时，细鬼的境遇也愈加危险。一年前的悲剧似乎将再次重演，李沧东该如何选择……