泽渡家的姐妹泉和美月为了保护宠物鳄鱼而离家出走，走投无路的她们经过一间大宅，发现招募女仆的告示。这间豪宅的主人是一位14岁少年——中林义贵，因为义贵的父母意外过世，义贵只得继承万贯家财，一个人住在豪宅。 泉见义贵一表人才，便接受女仆的工作。可是没过多久，义贵就暴露了自己的兴趣，原来义贵是一个“萝莉控、制服狂、偷拍狂及GalGame狂”！ 想要逃跑的泉慌乱下打碎义贵的一个花瓶，欠下巨额债务，难道两姐妹就要和这个变态住在一起，并作为女仆服侍他吗？其实，这只是一个开始。
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在《纳米核心》的里世界中，各位主角配角以及龙套们，都要在“纳米学院”中学习生活。大家在这个世界不那么认真地上课、考试、过着奇奇怪怪的校园日常，并不正经地保护着这个世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。
第二季特典动画短篇，共5话，每话5分钟。 映像特典 第2期 BD&DVD卷数//发售日//收录特典日文标题//中文标题 1//2014年9月26日//ファーストブラ イリヤ编//第一次穿胸罩 伊莉雅篇 2//2014年10月31日//ファーストブラ 美游编//第一次穿胸 罩 美游篇 3//2014年11月28日//おねえちゃんの人肌治疗//姐姐的人肌治疗 4//2014年12月26日//小学生チャイナドレス 5//2015年1月30日//魔法少女プリズマ×××
