在音乐、艺术、体育等各种娱乐领域备受期待的年轻菁英们，齐聚于私立格洛莉亚学园。其中，音乐科招收的是与伟大音乐家的「才能」相契合之人，并将这份天赋「Gift」移植于体内，使其以该音乐家的名字为名。因伤意外发现适应性的少年贝多芬，亦成为其中一员。转入学园后，他与继承不同「Gift」的伙伴们相遇，在音乐的魅力中成长，并立志夺得音乐大赛的冠
表面上过着平凡高中生活的红真九郎，实际上是经营着所谓的麻烦事务处理所的麻烦解决人。一日，同样负责解决事务的柔泽红香小姐，收到了保护神秘少女九凤院紫的任务。本不想接受任务的红香，在少女的表情之下动容，要求真九郎负责这一任务。第二天，住在真九郎寓所的紫感到不安，而真九郎不顾其感受去学校上学。结果，当他从学校回到家中，紫已经不知去向。 委托人真九郎能否完成任务？紫的真实身份又是什么？根据小说《红》改编的动画，将会对迷题一一解答。
