这部动画片讲述了剪刀、石头、布这三个孩子在大千世界中寻求知识的生动的、有趣的故事。在内容上选取了自然科学、社会科学、人文科学等多个领域中在现代科技发展上的热门话题，以生动有趣的故事为叙事平台，通过较为直观的科学试验和科学原理的介绍，使知识的传授不再是僵硬死板的灌输，而成为轻松活泼的游戏和娱乐。除了这三个主要人物之外，该片还有科学家、动画导演、欧洲妇人以及大象、刺猬、山羊、企鹅、海中鱼类等众多造型。由于每一集内容的不同，因而每一集都会有许多新的造型出现。..
表面上过着平凡高中生活的红真九郎，实际上是经营着所谓的麻烦事务处理所的麻烦解决人。一日，同样负责解决事务的柔泽红香小姐，收到了保护神秘少女九凤院紫的任务。本不想接受任务的红香，在少女的表情之下动容，要求真九郎负责这一任务。第二天，住在真九郎寓所的紫感到不安，而真九郎不顾其感受去学校上学。结果，当他从学校回到家中，紫已经不知去向。 委托人真九郎能否完成任务？紫的真实身份又是什么？根据小说《红》改编的动画，将会对迷题一一解答。
