新纪元2045年，世界各个区域陆续出现“天罚”，被天罚影响的区域会变成游戏世界，男主李肖所在的地区也受到天罚，区域游戏化，他发现自己成为了玩家，区域结界内的大家纷纷继承了之前游戏中的部分能力，如御兽、RPG游戏、解谜类游戏、修仙游戏、格斗游戏等，各显神通，不做统一详细的等级能力划分。自此开始了一场末日游戏的冒险
表面上过着平凡高中生活的红真九郎，实际上是经营着所谓的麻烦事务处理所的麻烦解决人。一日，同样负责解决事务的柔泽红香小姐，收到了保护神秘少女九凤院紫的任务。本不想接受任务的红香，在少女的表情之下动容，要求真九郎负责这一任务。第二天，住在真九郎寓所的紫感到不安，而真九郎不顾其感受去学校上学。结果，当他从学校回到家中，紫已经不知去向。 委托人真九郎能否完成任务？紫的真实身份又是什么？根据小说《红》改编的动画，将会对迷题一一解答。
