《我的逆天神器》主要讲述了屌丝青年常天在一次危机时刻，竟召唤出了传说中的神兵器作为“贴身护卫”，从此便与幻化成人型的神兵器小白形影不离。在与小白并肩战斗的过程中，常天还与豪门千金楚倾城结缘，关于上元武器库、元武者的种种神秘过往也一一展开
東京奪還編、開戦。 謎の少年?スティグマ率いる“アマラリルク”との戦いを経て少し成長したシャイ。 日本に戻ってきた彼女が出会ったのは、忍者の里から家出中という少女?天王寺曖だった。 彼女は“アマラリルク”の一員を追って里を出てきたとシャイに告げる。 そんな中、東京が突如黒球に包まれて消失する事件が発生。ヒーローたちは東京を救出するため出動するーー。
