《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
主人公方寒在经历了残酷的仙魔斗争、同门的尔虞我诈、挚爱红怡牺牲之后，内心逐渐从懵懂少年成长为沉着果决的男人。
结城友奈每天早上起床、做好准备出门上学、上课、参加社团活动、和朋友一起玩……她就是这样过着普通日常的中学2年生。如果非要kkju.cc找出特殊的地方的话，那就是她所属的社团是“勇者部”…
动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……
长谷川现（岛崎信长 配音）和妹妹阿梦（木户衣吹 配音）一直以来都生活在家庭暴力的阴影之下，父亲鬼岛四郎（游佐浩二 配音）的残酷与暴戾早已经超越了正常人可以承受的极限，兄妹两人从小就知道，对于动不动就对妻子和孩子拳打脚踢的这个男人，他们要有多远躲多远。 父母离婚之后，母亲离家出走之后，就真的只剩下阿现和阿梦相依为命了，在阿现的眼中，妹妹的一切就是他的整个世界，为了妹妹，他无论做什么都心甘情愿。不幸的是，阿梦在意外之中感染了名为“pupa”的神秘病毒，逐渐变成了嗜血和好食人肉的怪物，而阿现自己似乎也受到了病毒的影响，拥有了可以无限自愈的能力。就这样，阿现将自己献给了阿梦，成为了她的“食物”。
在一千年前，人类和恶灵互相战斗著。人类藉著圣兽的帮忙，远古的百兽战士大神月磨击败了欧陆克的领袖，而且封印了他。现在，欧陆克开始复苏，五个年轻人被圣兽认定。他们一定要放弃他们的现在生命而变成新一代的牙吠连者保护地球的和平。
商周之战一千五百年后，天界衰落，蒙冤落魄的杨戬以赏银捕手为业谋生。一日，杨戬接受了一位神秘访客的赏银去追捕一位少年，意外发现少年竟是自己的亲外甥沉香。沉香立志要寻回宝莲灯，劈山救母，却将酿成大祸。杨戬踏上追寻沉香并揭开尘封往事的旅程……
