故事发生在解放战争时期。潜伏在国民党內部的中共地下党员马昀飞（于震 饰）被任命为国防部特勤组长，带人到东京押解南京大屠杀的元凶石岩夫（刘文治 饰）回国审判，不料一路上受到种种波折和阻挠，里面有军国主义的死硬分子，也有隐藏在军委会的汉奸高官。特勤小组在马昀飞带领下，始终将民族大义和国家利益放在首位，沖破各种艰难困苦，终于将战犯押解至南京法庭，并捎带揭露出731细菌部队的骇人暴行。正当完成仼务准备归队，闻讯传来石岩夫旧部劫狱的消息，马昀飞再次飞赴一线，与其劫狱旧部展开搏杀，他的英勇行为连一直监视他的孟凡彬（黄俊鹏 饰）都感到由衷赞叹......
抗战胜利前夕，潜伏在军统的中共地下党员欧孝安（黄景瑜 饰）从日军生化毒气研究所监狱中成功越狱，途中受重伤昏迷，被中国远征军发现并救走。苏醒后的欧孝安发现自己丧失了在监狱近四年的记忆。欧孝安以四年前记忆的终点为起点，捡拾零星记忆，秘密调查并意图揭露日本间谍黎少堂（马思超 饰）的罪恶嘴脸。期间，他与中共地下党员覃墨卿（辛芷蕾 饰）从相互质疑、试探，到联手合作，找到了日军生化毒气研究所，抓获了日军情报司令长官大桥和野。抗战胜利后，国民党准备全盘接收日军生化毒气研究所遗留的“人、财、物”，为日后与中共作战做准备。欧孝安获悉了这个情报并粉碎了这个恶毒计划，同时揭露了黎少堂日本间谍的真面目，在中共地下党内代号为“孤星”的欧孝安终于回到了党组织的怀抱。
代笔少女涂茶茶，为掩盖温家小姐与他人相好，不得不以温家小姐的名义代写情书，一来二去，却不想爱上了通信之人沈不言。为阻止温家老爷陷害沈不言，涂茶茶组建一个临时家庭冒充温府全家想劝退沈不言，没想到却误入反派温老爷设计的圈套之中，冒名顶替的身份让他们陷入一场杀身之祸。涂茶茶与沈不言及临时家庭携手完美演绎了一场"戏中戏"，掀开了一场惊天阴谋。
该剧以上世纪30年代我军历史上的英雄部队红三十四师的壮烈事迹为素材而创作，聚焦重大历史转折时期红军生死存亡的关键时刻，表现了我党我军历史上最为艰苦的一段历程。
一部弘扬主旋律的电视剧，谱写了新型农民在改革开放大潮中艰苦奋斗的创业史，该剧获得全国第三届“农村小康电视节目工程”二等奖。小鼓大戏》的成功，也为今后农村影视剧市场化运作探索出一种新模式。
