美国国防部前雇员声称存在一个秘密政府项目，该项目已调查并隐瞒了外星智慧的证据长达80多年。
故事讲述宇航员任务期间突发意外，伤病严重无法支撑返回地球治疗。情急之下，一名女外科医生临危受命，亲身飞赴空间站展开救援行动。时间有限，巨大的困难与挑战下，一场零重力下的极限救援即将上演！ 影片为人类首部太空实拍电影。
太平洋某座生物研究所内，最新研究的鱼类加速繁殖计划得到了突破，并在繁殖力极低的鲨鱼身上试验成功。实验室的科学家们大喜过望，称这项研究将彻底解决全球食物问题。只有总负责人博士袁聪认为此举会破坏现有的生态环境，力排众议下令销毁实验鲨鱼。然而实验组的副手莫雷将这些鲨鱼看成毕生心血，偷走几条幼鲨准备转移，谁知在路上被咬伤出了事故，幼鲨逃进下水道进入了大海。没过多久，若干处海边出现鲨鱼群体袭击事件，原来这些鲨鱼的背后有一只超级巨大的母鲨......
园田真理、菊池启太郎的侄子条太郎、海堂直也与不知何时回来的草加雅人，一同经营着“菊池西洋洗涤铺”，同时也为俄尔以诺提供庇护。 而由政府重组的智脑公司已转变为一家旨在消灭俄尔以诺的公司，由北崎领导。 某天，为拯救被追杀的俄尔以诺，草加与海堂变身为假面骑士凯撒和蛇俄尔以诺，与消灭俄尔以诺小队的队长胡桃玲菜交战。 在那里出现了消失数年、下落不明的乾巧。乾巧变身为全新形态——假面骑士次世代555（暂译），作为智脑公司阵营的头部战力，与真理等人对战。 遭到攻击的真理等人都对此感到不解。乾巧为何会出现在智脑公司？失踪至今都在做些什么…… 这一戏剧性的重逢，拉开了俄尔以诺与人类故事的新篇章……
由于环境严重的污染，使得蝌蚪受到突变而成为黑多拉，并且造成极大的破坏，人类几乎束手无策，而哥吉拉也费尽了极大的心思跟他战斗，最后人类与哥斯拉一同战胜了黑多拉。
